RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 PTP4A2Q12974 167 aa22.51■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 BNIP3Q12983 259 aa22.51■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.51■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 OR7D4Q8NG98 312 aa22.51■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.51■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ZNF462Q96JM2 2506 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 LGALS16A8MUM7 142 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 BNIP3LO60238 219 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PRNPP04156 253 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PTPN9P43378 593 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ATP11AP98196 1134 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PROX2Q3B8N5 592 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 NEK5Q6P3R8 708 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 LINGO4Q6UY18 593 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 GBP4Q96PP9 640 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 LGMNQ99538 433 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CEP44Q9C0F1 390 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 NEU3Q9UQ49 428 aa22.5■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SRGAP2O75044 1071 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SDC4P31431 198 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 STAT1P42224 750 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ARF5P84085 180 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 E2F1Q01094 437 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 MYL5Q02045 173 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 GNA12Q03113 381 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SYCP1Q15431 976 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CCDC14Q49A88 953 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RAB6CQ53S08 254 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RETSATQ6NUM9 610 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PCSK4Q6UW60 755 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 STRADAQ7RTN6 431 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CHST14Q8NCH0 376 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ARRDC3Q96B67 414 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ANO10Q9NW15 660 aa22.49■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 J3QKU1 62 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ADRA1BP35368 520 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 UCNP55089 124 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SLC20A2Q08357 652 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 STX1AQ16623 288 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 NLRP14Q86W24 1093 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 HDAC8Q9BY41 377 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.48■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RNF103O00237 685 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 MAPKAPK2P49137 400 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 TMPRSS3P57727 454 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RHDQ02161 417 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CDO1Q16878 200 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.47■■□□□ 1.19
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SRRT-218ENST00000620394 IL36AQ9UHA7 158 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 COL6A6A6NMZ7 2263 aa22.47■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 SDC3O75056 442 aa22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CD160O95971 181 aa22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 MT-CO3P00414 261 aa22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ETFBP38117 255 aa22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 HDAC4P56524 1084 aa22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 NCAPHQ15003 741 aa22.46■■□□□ 1.19
SRRT-218ENST00000620394 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.46■■□□□ 1.19
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