RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 RIPOR3Q96MK2 946 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPATA33Q96N06 139 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MED15Q96RN5 788 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FIZ1Q96SL8 496 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAP7D2Q96T17 732 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NDST4Q9H3R1 872 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZHX3Q9H4I2 956 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 DMTF1Q9Y222 760 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NEU2Q9Y3R4 380 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NRCAMQ92823 1304 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 DENND3A2RUS2 1198 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDHR4A6H8M9 788 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF785A8K8V0 405 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSPH10B2B2RC85 870 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MATN3O15232 486 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 EXOC3O60645 756 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SOAT2O75908 522 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CABYRO75952 493 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNAJB5O75953 348 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FGF18O76093 207 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 STBD1O95210 358 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGB1P05556 798 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MMP3P08254 477 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSPH10BP0C881 870 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYBAP13498 195 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNFRSF1AP19438 455 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNFSF4P23510 183 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 AXLP30530 894 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARL2P36404 184 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NPTX2P47972 431 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 LIG4P49917 911 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CHN2P52757 468 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PEX3P56589 373 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SATB1Q01826 763 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SP2Q02086 613 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SP3Q02447 781 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NHLH2Q02577 135 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNFAIP2Q03169 654 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF844Q08AG5 666 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TCF15Q12870 199 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CTBP1Q13363 440 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TUBA3CQ13748 450 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CSRP2Q16527 193 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAPK6Q16659 721 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 LY6KQ17RY6 165 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TUBA3EQ6PEY2 450 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 DLK2Q6UY11 383 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GBP6Q6ZN66 633 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC186Q7Z3E2 898 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPRED1Q7Z699 444 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TLK2Q86UE8 772 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 VPS36Q86VN1 386 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SESTD1Q86VW0 696 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC170Q8IYT3 715 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPD1LQ8N335 351 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NME8Q8N427 588 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR2C3Q8N628 320 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RNF169Q8NCN4 708 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NEK11Q8NG66 645 aa3.63□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR8K1Q8NGG5 319 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms