RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSG101	Q99816	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TJP1	Q07157	1748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COL4A5	P29400	1685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H3BNX3	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DCLK1	O15075	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHUK	O15111	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MT-CO1	P00395	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPING1	P05155	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LDHC	P07864	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPR1	P16066	1061 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC8A1	P32418	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEA1	P43355	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	E2F2	Q14209	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MTF1	Q14872	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPY5R	Q15761	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A087WWV3	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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