RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	CDC16	Q13042	620 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	FOXE3	Q13461	319 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TUBA3C	Q13748	450 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	RPE65	Q16518	533 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TSSK4	Q6SA08	328 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TDRP	Q86YL5	185 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	KLB	Q86Z14	1044 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	GTF3C6	Q969F1	213 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC17	Q96LX7	622 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SH2D4A	Q9H788	454 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SYBU	Q9NX95	663 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A17	O43808	307 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	DDAH2	O95865	285 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SERPINC1	P01008	464 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	HKR1	P10072	659 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	AKR1A1	P14550	325 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SOX2	P48431	317 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	MTA1	Q13330	715 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	RUNX2	Q13950	521 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	PTPA	Q15257	358 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	TAF11	Q15544	211 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	GSTA3	Q16772	222 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	AADACL2	Q6P093	401 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	KAT2A	Q92830	837 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf74	Q96LT6	269 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CDH22	Q9UJ99	828 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF202	O95125	648 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	IL1A	P01583	271 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	RB1	P06400	928 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	NR2F1	P10589	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	IL7R	P16871	459 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	GNAQ	P50148	359 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP2J2	P51589	502 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ARSF	P54793	590 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	F2RL1	P55085	397 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	CRYM	Q14894	314 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	VEPH1	Q14D04	833 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	PLCB4	Q15147	1175 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP2R5B	Q15173	497 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	C5orf22	Q49AR2	442 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB41	Q5JT25	222 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATP9B-223	ENST00000590608	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58

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