RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 LEFTY1O75610 366 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 RHOCP08134 193 aa22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 IRAK1P51617 712 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 FGL2Q14314 439 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 TBR1Q16650 682 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 LINGO4Q6UY18 593 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 GPR27Q9NS67 375 aa22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 F13A1P00488 732 aa22.23■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 LIPCP11150 499 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 GP1BBP13224 206 aa22.23■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 CMA1P23946 247 aa22.23■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA3CQ99985 751 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 SIK2Q9H0K1 926 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS51Q9UID3 782 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.22■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 GCATO75600 419 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 IGLV3-25P01717 112 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 GPD2P43304 727 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP4F2P78329 520 aa22.22■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.22■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 CDH4P55283 916 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 TCEA2Q15560 299 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 DEFB106AQ8N104 65 aa22.2■■□□□ 1.14
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CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM74Q96NL1 305 aa22.2■■□□□ 1.14
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CAPNS1-205ENST00000588780 D6RAR5 112 aa22.19■■□□□ 1.14
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CAPNS1-205ENST00000588780 MTA1Q13330 715 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC35C1Q96A29 364 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SPON2Q9BUD6 331 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.19■■□□□ 1.14
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