RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CCDC103Q8IW40 242 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PALM2Q8IXS6 379 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 HACE1Q8IYU2 909 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 NME8Q8N427 588 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 EMC1Q8N766 993 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MCUQ8NE86 351 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MGARPQ8TDB4 240 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FRS2Q8WU20 508 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KAT2BQ92831 832 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TNIP3Q96KP6 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PEBP4Q96S96 227 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PAFAH2Q99487 392 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 APBA2Q99767 749 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TINF2Q9BSI4 451 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CALN1Q9BXU9 219 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CAPN10Q9HC96 672 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KLC4Q9NSK0 619 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MKS1Q9NXB0 559 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TBK1Q9UHD2 729 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 Q9Y3F1 56 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 H7C0C1 242 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PIRO00625 290 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CHUKO15111 745 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GPR32O75388 356 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 DCTN3O75935 186 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TMEM63AO94886 807 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZBED1O96006 694 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 IL1BP01584 269 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FUCA1P04066 466 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 NTRK1P04629 796 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CD48P09326 243 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GNAT1P11488 350 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PAMP19021 973 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TAC1P20366 129 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CA4P22748 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ALDH3A1P30838 453 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC8A1P32418 973 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ATP5OP48047 213 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TAF6P49848 677 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CPT1AP50416 773 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 AIF1P55008 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 BCAR1P56945 870 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC8A3P57103 927 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GPX6P59796 221 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CDK16Q00536 496 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 BNIP1Q12981 228 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 RIPK1Q13546 671 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SNCBQ16143 134 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GALNTL6Q49A17 601 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CCDC14Q49A88 953 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 LGSNQ5TDP6 509 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 HHATQ5VTY9 493 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 DLK2Q6UY11 383 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TTC30AQ86WT1 665 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CHSY1Q86X52 802 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FUKQ8N0W3 1084 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CCDC63Q8NA47 563 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 UBA3Q8TBC4 463 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.49□□□□□ -1.37
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