RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PANX2Q96RD6 677 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CEP44Q9C0F1 390 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 EBF2Q9HAK2 575 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 VPS45Q9NRW7 570 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 LHX3Q9UBR4 397 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 FZD4Q9ULV1 537 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 SPEGQ15772 3267 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 METTL12A8MUP2 240 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 H3BRJ5 948 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 INSIG1O15503 277 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 MFSD11O43934 449 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PRAMEF11O60813 436 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 GJB3O75712 270 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 SEMA4FO95754 770 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PEX11BO96011 259 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ADH1BP00325 375 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 DESP17661 470 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CHRNA3P32297 505 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 GJC1P36383 396 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 NNMTP40261 264 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 NDST2P52849 883 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CDH6P55285 790 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 IRX4P78413 519 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 BNC1Q01954 994 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 LMNB2Q03252 620 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 SLC20A2Q08357 652 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CNTN1Q12860 1018 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 DPYSL3Q14195 570 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CYTH1Q15438 398 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 BOLA3Q53S33 107 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 LAYNQ6UX15 382 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 SYT12Q8IV01 421 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PQLC3Q8N755 202 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 SPC24Q8NBT2 197 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 RAPGEF5Q92565 580 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 SGK2Q9HBY8 427 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CAPN10Q9HC96 672 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 INTUQ9ULD6 942 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 SCML1Q9UN30 329 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 MUSKO15146 869 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 BUB1O43683 1085 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 NDUFS2O75306 463 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 LEFTY1O75610 366 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 NDUFA10O95299 355 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 GSRP00390 522 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 HOXD12P35452 270 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ABL2P42684 1182 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 MAGEA1P43355 309 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 MARCKSL1P49006 195 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 MESDQ14696 234 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CARD16Q5EG05 197 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ARSIQ5FYB1 569 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 TMIEQ8NEW7 156 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 BIRC7Q96CA5 298 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 EXOC2Q96KP1 924 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF670Q9BS34 389 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 EDEM2Q9BV94 578 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC33-211ENST00000563951 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms