RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562075.6

CNN2-204, Transcript of calponin 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CNN2, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2-204ENST00000562075 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MPP3Q13368 585 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 OLIG2Q13516 323 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 SLC12A1Q13621 1099 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 STAT4Q14765 748 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CASC4Q6P4E1 433 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 APCDD1Q8J025 514 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MPP5Q8N3R9 675 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ALG14Q96F25 216 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 SEMA3CQ99985 751 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CENPHQ9H3R5 247 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 VPS45Q9NRW7 570 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 BFARQ9NZS9 450 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 VPS51Q9UID3 782 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CDH7Q9ULB5 785 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.51□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 A0A1W2PPC1 479 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TLDC2A0PJX2 215 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 RASGRF2O14827 1237 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MUSKO15146 869 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ZMPSTE24O75844 475 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TMCC1O94876 653 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 AGTP01019 485 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 GSTA2P09210 222 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TYRP14679 529 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 SSTR1P30872 391 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CD70P32970 193 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 NPY2RP49146 381 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 WNT3AP56704 352 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CDH17Q12864 832 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CYTH1Q15438 398 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 PCSK7Q16549 785 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 RETSATQ6NUM9 610 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 KDELC1Q6UW63 502 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 LINGO4Q6UY18 593 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 PSKH2Q96QS6 385 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MGME1Q9BQP7 344 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 SYBUQ9NX95 663 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CLDND1Q9NY35 253 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 OBP2AQ9NY56 170 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MARK1Q9P0L2 795 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CLEC1BQ9P126 229 aa14.5□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 RNF40O75150 1001 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TBX10O75333 385 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ADH1CP00326 375 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MMP2P08253 660 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ADRA1AP35348 466 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 PLK1P53350 603 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CRADDP78560 199 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 SKOR1P84550 965 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 GRIN2CQ14957 1233 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 DHCR24Q15392 516 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 CCNJLQ8IV13 435 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 FBF1Q8TES7 1133 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ACDQ96AP0 544 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 ARL8AQ96BM9 186 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 LMLNQ96KR4 655 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 NAT9Q9BTE0 207 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 S1PR5Q9H228 398 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.49□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TRANK1O15050 2925 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 TCEA3O75764 348 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN2-204ENST00000562075 NFATC1O95644 943 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms