RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 MUSKO15146 869 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SUV39H1O43463 412 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 LEFTY1O75610 366 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 GLI1P08151 1106 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ADRB3P13945 408 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 GGCXP38435 758 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 CLCN6P51797 869 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 MTA1Q13330 715 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 IL12RB2Q99665 862 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 TEX15Q9BXT5 2789 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 A0A1W2PQ27 194 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 A0A1W2PQ64 194 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 P4HA2O15460 535 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 AP1G1O43747 822 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PAGE1O75459 146 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ITGB2P05107 769 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC5A2P31639 672 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 NEK3P51956 506 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PFN3P60673 137 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 LRRC63Q05C16 580 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ALFQ53S48 1182 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ARTNQ5T4W7 220 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 COX16Q9P0S2 106 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 A0A0D9SEW6 157 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ITGB7P26010 798 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 L1CAMP32004 1257 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 NFKB2Q00653 900 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PDCLQ13371 301 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PNOCQ13519 176 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 TGIF1Q15583 401 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 LINGO4Q6UY18 593 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 RBFAQ8N0V3 343 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ASB12Q8WXK4 309 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 EXTL1Q92935 676 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 NAT6Q93015 286 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SGF29Q96ES7 293 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SEMA3CQ99985 751 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SPASTQ9UBP0 616 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 LMO7DNF2Z398 122 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 I6L893 689 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 FPGTO14772 594 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PLD2O14939 933 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 GJB6O95452 261 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 RPIAP49247 311 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SPIDRQ14159 915 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 USP53Q70EK8 1073 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 TBATAQ96M53 351 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 CLPBQ9H078 707 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 SIK2Q9H0K1 926 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 ACP6Q9NPH0 428 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 RMND1Q9NWS8 449 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-214ENST00000560163 IGLON5A6NGN9 336 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 DRGXA6NNA5 263 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 YY2O15391 372 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 MED7O43513 233 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 RHOCP08134 193 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 UGT1A5P35504 534 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 C1orf61Q13536 156 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 SPATA20Q8TB22 786 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 GLMNQ92990 594 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 CENPTQ96BT3 561 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-214ENST00000560163 CPXM1Q96SM3 734 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms