RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550722.5

HECTD4-211, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HECTD4, Length 15,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-211ENST00000550722 PDGFAP04085 211 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ITGB1P05556 798 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 USP17L24Q0WX57 530 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 APOL2Q9BQE5 337 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 BCS1LQ9Y276 419 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 AP1G1O43747 822 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 PRKCAP17252 672 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KBTBD6Q86V97 674 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CAPN8A6NHC0 703 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 FGFR3P22607 806 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CAPZA2P47755 286 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CAMK2BQ13554 666 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 C9orf72Q96LT7 481 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CCNDBP1O95273 360 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CRTAMO95727 393 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 SHBGP04278 402 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 NFICP08651 508 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 GIT2Q14161 759 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 TAF5Q15542 800 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CNSTQ6PJW8 725 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 DHFR2Q86XF0 187 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 EFHBQ8N7U6 833 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KDM1BQ8NB78 822 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 MCFD2Q8NI22 146 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 NTN4Q9HB63 628 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 F5H423 210 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 F5H6K3 240 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ABHD2P08910 425 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 MATN1P21941 496 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KLRC3Q07444 240 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 OCLNQ16625 522 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 DPP10Q8N608 796 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KCT2Q8NC54 265 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 EMSYQ7Z589 1322 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 USP17L10C9JJH3 530 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 PTTG1O95997 202 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ITGA8P53708 1063 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 BIKQ13323 160 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KIF12Q96FN5 646 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 MBD5Q9P267 1494 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 USP6P35125 1406 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CAPN14A8MX76 684 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 C5orf58C9J3I9 102 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 BNIP3LO60238 219 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 FBXW4P57775 412 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CCNJQ5T5M9 372 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CYP2C18P33260 490 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CENPCQ03188 943 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 MROQ9BYG7 248 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 VPS33BQ9H267 617 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 MMP27Q9H306 513 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 OR14I1A6ND48 311 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 RBP3P10745 1247 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 HOXD13P35453 343 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 SEC23AQ15436 765 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 GPD1LQ8N335 351 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 RHOBTB3O94955 611 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 SRCP12931 536 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CTRB1P17538 263 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 ERFEQ4G0M1 354 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.28□□□□□ -1.4
HECTD4-211ENST00000550722 HPS6Q86YV9 775 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms