RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 TPP1O14773 563 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 COCHO43405 550 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CREMQ03060 361 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMG2Q969U7 264 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 E2F7Q96AV8 911 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 GLOD4Q9HC38 313 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 DONSONQ9NYP3 566 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SOX13Q9UN79 622 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 GLRA3O75311 464 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP5HO75947 161 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TMPRSS15P98073 1019 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RING1Q06587 406 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 HECTD3Q5T447 861 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 POF1BQ8WVV4 589 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL29Q96CT2 875 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MECRQ9BV79 373 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF38Q9H0F5 515 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MAFFQ9ULX9 164 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IRAK3Q9Y616 596 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf78A6NCI8 922 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHB3P54753 998 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 VEPH1Q14D04 833 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF12Q16514 161 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD3Q96ES6 412 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IL21Q9HBE4 155 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 LZTS1Q9Y250 596 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NEBLO76041 1014 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC5CO95185 931 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 F11P03951 625 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 BPGMP07738 259 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TPH1P17752 444 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMK1Q14012 370 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 DBN1Q16643 649 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ANO4Q32M45 955 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RBBP8Q99708 897 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0G2JND7 137 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOQP17081 205 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TYK2P29597 1187 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 GEMP55040 296 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC20A2Q08357 652 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CHI3L2Q15782 390 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNMB4Q86W47 210 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF8Q969P0 613 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 C7orf26Q96N11 449 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTN5O94779 1100 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NDST2P52849 883 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ARFIP2P53365 341 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 BST1Q10588 318 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 INSCQ1MX18 579 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXL22Q6P050 247 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 WBP2Q969T9 261 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KIFC1Q9BW19 673 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 GKN1Q9NS71 199 aa20.55■□□□□ 0.88
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