RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 CNTN6Q9UQ52 1028 aa5.17□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 NUDCQ9Y266 331 aa5.17□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 KIF15Q9NS87 1388 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 UNC13BO14795 1591 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 AGAP5A6NIR3 686 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 BUB3O43684 328 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 DAOP14920 347 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 THPOP40225 353 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 PCP4P48539 62 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 TRAF3Q13114 568 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 MIGA1Q8NAN2 632 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 PJA1Q8NG27 643 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 MUL1Q969V5 352 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 NPAS1Q99742 590 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.16□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 PREX2Q70Z35 1606 aa5.15□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
SGCE-211ENST00000522045 TMEM247A6NEH6 219 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ASNA1O43681 348 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 UMODP07911 640 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PRPH2P23942 346 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PRKCHP24723 683 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 GSTM2P28161 218 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PKP1Q13835 747 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 BTBD16Q32M84 506 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ZACNQ401N2 412 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FBXL22Q6P050 247 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FRG2BQ96QU4 278 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CDH22Q9UJ99 828 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PLXNC1O60486 1568 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 WDR81Q562E7 1941 aa5.15□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 LINC01553A4QN01 128 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SERPINI2O75830 405 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TYK2P29597 1187 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TRIM60Q495X7 471 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 MON1BQ7L1V2 547 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 RSC1A1Q92681 617 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1191Q96A73 305 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 IFT27Q9BW83 186 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 IL25Q9H293 177 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.14□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ATP10AO60312 1499 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A18PA6NE21 464 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ITM2AO43736 263 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 MMP3P08254 477 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CLCNKBP51801 687 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP10-5P60370 271 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAR1Q8WVX9 515 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CCDC138Q96M89 665 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SEL1LQ9UBV2 794 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 LZTS1Q9Y250 596 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ATP10BO94823 1461 aa5.13□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ANO9A1A5B4 782 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 EYA2O00167 538 aa5.12□□□□□ -1.59
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