RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 CD58P19256 250 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ITIH1P19827 911 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 KLRC2P26717 231 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TMBIM6P55061 237 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 COPZ1P61923 177 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DNASE1L3Q13609 305 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 POU6F1Q14863 301 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DUSP7Q16829 419 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 BBS9Q3SYG4 887 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TEX44Q53QW1 395 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ATG16L1Q676U5 607 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MON1BQ7L1V2 547 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 COPS5Q92905 334 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TTC17Q96AE7 1141 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 APOPT1Q96IL0 206 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SNX18Q96RF0 628 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GPR20Q99678 358 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 EBF4Q9BQW3 602 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RNF181Q9P0P0 153 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SHOXO15266 292 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TOM1L1O75674 476 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GJC1P36383 396 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 OSTNP61366 133 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SLC18A2Q05940 514 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FAAP100Q0VG06 881 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 BST1Q10588 318 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 IKBKEQ14164 716 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DLG2Q15700 870 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CES4AQ5XG92 561 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ERO1BQ86YB8 467 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SGCDQ92629 289 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 HMG20AQ9NP66 347 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 I3L4J1 428 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SOCS7O14512 581 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ASNA1O43681 348 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 UGT2B4P06133 528 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 KRT10P13645 584 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PTGS2P35354 604 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 NOMO3P69849 1222 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 NME3Q13232 169 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SELPLGQ14242 412 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 KCTD2Q14681 263 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ZPBP2Q6X784 338 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PLPP6Q8IY26 295 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.58□□□□□ -1.04
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TRPS1-209ENST00000519674 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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TRPS1-209ENST00000519674 FAM167AQ96KS9 214 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SPATA33Q96N06 139 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PLOD2O00469 737 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF254O75437 659 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PRKCBP05771 671 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 COL6A1P12109 1028 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 EFNA5P52803 228 aa8.58□□□□□ -1.04
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