RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 KIF5AQ12840 1032 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM14Q14142 442 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 TIGD6Q17RP2 521 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 ATG9BQ674R7 924 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 FAM216AQ8WUB2 273 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 CKAP5Q14008 2032 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 A0A096LPK6 155 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-221ENST00000514231 FAM157AC9JC47 383 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 GPR12P47775 334 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 RGS19P49795 217 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 RRP1P56182 461 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 CUL4BQ13620 913 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-221ENST00000514231 CCDC174Q6PII3 467 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-221ENST00000514231 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 THAP4Q8WY91 577 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM18Q96B42 140 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 CHODLQ9H9P2 273 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 ITM2AO43736 263 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R3DO95685 299 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF12P17014 697 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 ADD2P35612 726 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 PDLIM4P50479 330 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 GAS1P54826 345 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 IL13RA2Q14627 380 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 PLCB4Q15147 1175 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 SETD9Q8NE22 299 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.47□□□□□ -1.53
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PDE4D-221ENST00000514231 LMLNQ96KR4 655 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 VPS33BQ9H267 617 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 NLKQ9UBE8 527 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 CD207Q9UJ71 328 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-221ENST00000514231 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 CBX6O95503 412 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 IL1AP01583 271 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 TK1P04183 234 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.46□□□□□ -1.54
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PDE4D-221ENST00000514231 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 GJB7Q6PEY0 223 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 Q6ZTC4 211 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 FJX1Q86VR8 437 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 MIGA1Q8NAN2 632 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 RTP4Q96DX8 246 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 DERAQ9Y315 318 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 KCNJ13O60928 360 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 MT3P25713 68 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 CHKAP35790 457 aa5.45□□□□□ -1.54
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PDE4D-221ENST00000514231 PRKG1Q13976 671 aa5.45□□□□□ -1.54
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PDE4D-221ENST00000514231 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 LINS1Q8NG48 757 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 LHPPQ9H008 270 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1B0GUV1 79 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 IFITM10A6NMD0 228 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 CHL1O00533 1208 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 ACTR2P61160 394 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 MYBPC2Q14324 1141 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 POSTNQ15063 836 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 KIF19Q2TAC6 998 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 CTXN3Q4LDR2 81 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-221ENST00000514231 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.44□□□□□ -1.54
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