RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 NLRP14Q86W24 1093 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR7D4Q8NG98 312 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 LMLNQ96KR4 655 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAGEH1Q9H213 219 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 CAPN10Q9HC96 672 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERVW-1Q9UQF0 538 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAD54BQ9Y620 910 aa11.22□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 DFFAO00273 331 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARHGAP33O14559 1287 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 KRT1P04264 644 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 HLA-EP13747 358 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERCC2P18074 760 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 AMPD1P23109 780 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACVRL1P37023 503 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 IL12RB1P42701 662 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLK1P53350 603 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRRC38Q5VT99 294 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 RETSATQ6NUM9 610 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 POLNQ7Z5Q5 900 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 NAXDQ8IW45 347 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 SUN2Q9UH99 717 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 HCN2Q9UL51 889 aa11.21□□□□□ -0.61
CD27-AS1-204ENST00000504270 KALRNO60229 2985 aa11.21□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A0U1RQJ8 604 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 WASH4PA8MWX3 477 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 RASA4BC9J798 803 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 RASA4O43374 803 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 BNIP3LO60238 219 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 SNAP91O60641 907 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADAM23O75077 832 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 PALMO75781 387 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 SYPP08247 313 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 CD48P09326 243 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 KDELR1P24390 212 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 NDST2P52849 883 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 MMRN1Q13201 1228 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 DPYSL3Q14195 570 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 PTPRNQ16849 979 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 PARP15Q460N3 678 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARTNQ5T4W7 220 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 LINGO4Q6UY18 593 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 PEX26Q7Z412 305 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 LZTR1Q8N653 840 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF366Q8N895 744 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 DCAF4L2Q8NA75 395 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAPGEF5Q92565 580 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALG14Q96F25 216 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 GABRG3Q99928 467 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 VPS51Q9UID3 782 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 NEU3Q9UQ49 428 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.2□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.19□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 TTC34A8MYJ7 566 aa11.19□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 PSTPIP1O43586 416 aa11.19□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 GLDCP23378 1020 aa11.19□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRKCHP24723 683 aa11.19□□□□□ -0.62
CD27-AS1-204ENST00000504270 SERPINB6P35237 376 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms