RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SNTA1	Q13424	505 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	DCTN1	Q14203	1278 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	GXYLT1	Q4G148	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	IL31	Q6EBC2	164 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	KSR2	Q6VAB6	950 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SCAI	Q8N9R8	606 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	FAM71B	Q8TC56	605 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	NEK9	Q8TD19	979 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	HES6	Q96HZ4	224 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SGCZ	Q96LD1	299 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CLPB	Q9H078	707 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	UPB1	Q9UBR1	384 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268		A0A0U1RQJ8	604 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	LGALS16	A8MUM7	142 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TIMM23	O14925	209 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ARSA	P15289	507 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CHN1	P15882	459 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SSTR2	P30874	369 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CDK7	P50613	346 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	AK2	P54819	239 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	XKR9	Q5GH70	373 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	IFT27	Q9BW83	186 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	NLK	Q9UBE8	527 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SYN3	O14994	580 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CFC1	P0CG37	223 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ACP5	P13686	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	GLIPR1	P48060	266 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	NEK3	P51956	506 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	PTK2B	Q14289	1009 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	KRT71	Q3SY84	523 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TTC22	Q5TAA0	569 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	BICD1	Q96G01	975 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	RTKN	Q9BST9	563 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	KCND3	Q9UK17	655 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TMEM247	A6NEH6	219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CLGN	O14967	610 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ST3GAL1	Q11201	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	GALNT7	Q86SF2	657 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	NAGS	Q8N159	534 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CD101	Q93033	1021 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	EID2B	Q96D98	161 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	C8orf48	Q96LL4	319 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	PIGS	Q96S52	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	MYD88	Q99836	296 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	NFS1	Q9Y697	457 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CHL1	O00533	1208 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	ACTL6B	O94805	426 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	MMP3	P08254	477 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	CYP4B1	P13584	511 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	AMD1	P17707	334 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	DCTD	P32321	178 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	PPM1A	P35813	382 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	PTPN9	P43378	593 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP34-222	ENST00000498268	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81

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