RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 USP7Q93009 1102 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 BMFQ96LC9 184 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TBATAQ96M53 351 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LRRC61Q9BV99 259 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 HDAC8Q9BY41 377 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GPR27Q9NS67 375 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RAB20Q9NX57 234 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 IL36AQ9UHA7 158 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KLF15Q9UIH9 416 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GGT7Q9UJ14 662 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PLAAQ9Y263 795 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CACNA1DQ01668 2161 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RELNP78509 3460 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 O00370 1275 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RAD51BO15315 384 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 YY2O15391 372 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CUTAO60888 179 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PPP6R2O75170 966 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 VPS4BO75351 444 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LEFTY1O75610 366 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CNTN5O94779 1100 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CTSLP07711 333 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ADRB3P13945 408 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TSHRP16473 764 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CLCN6P51797 869 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RIPPLY3P57055 190 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CENPCQ03188 943 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ENPEPQ07075 957 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 STK4Q13043 487 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MTA1Q13330 715 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CUL2Q13617 745 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CUL4BQ13620 913 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 STILQ15468 1287 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ARSIQ5FYB1 569 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PMF1Q6P1K2 205 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MACC1Q6ZN28 852 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GKN2Q86XP6 184 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SEMA4DQ92854 862 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC39A13Q96H72 371 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 HSFY1Q96LI6 401 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 HAPLN3Q96S86 360 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ST7Q9NRC1 585 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 VPS4AQ9UN37 437 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GPR34Q9UPC5 381 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.27□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PQM1 296 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 IGLON5A6NGN9 336 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 C9orf172C9J069 976 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TOR1BO14657 336 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ZW10O43264 779 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SPINT1O43278 529 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MTSS1O43312 755 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN6O43657 245 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 AP1G1O43747 822 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CLDN11O75508 207 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms