RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SCLYQ96I15 445 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 UBP1Q9NZI7 540 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FETUBQ9UGM5 382 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GABRDO14764 452 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SPAG6O75602 509 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 OAZ2O95190 189 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GALTP07902 379 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PDHA1P08559 390 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LINGO3P0C6S8 592 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 COL9A1P20849 921 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ABCG1P45844 678 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC18A1P54219 525 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DAOAP59103 153 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TPI1P60174 286 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PPP2R5DQ14738 602 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TAF11Q15544 211 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PLPP4Q5VZY2 271 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF567Q8N184 647 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 C10orf82Q8WW14 230 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TMEM209Q96SK2 561 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TM9SF1O15321 606 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FGF18O76093 207 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LTFP02788 710 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 KITP10721 976 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SRFP11831 508 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB16Q05516 673 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LGSNQ5TDP6 509 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C16orf46Q6P387 395 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MCUQ8NE86 351 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 USP33Q8TEY7 942 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MYLPFQ96A32 169 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OLFM3Q96PB7 478 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DKK4Q9UBT3 224 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NOD1Q9Y239 953 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RFPL1O75677 317 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 KRT38O76015 456 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ERVK-10P10266 1014 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TSHRP16473 764 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EPHB2P29323 1055 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SCNN1AP37088 669 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ETV4P43268 484 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PPP3CCP48454 512 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NUMBP49757 651 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NEK3P51956 506 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS15P98073 1019 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 WASHC5Q12768 1159 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FZD5Q13467 585 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SEMA5AQ13591 1074 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PDK1Q15118 436 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RNF135Q8IUD6 432 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HACE1Q8IYU2 909 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NPWQ8N729 165 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ADAM2Q99965 735 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 VPS11Q9H270 941 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PIDD1Q9HB75 910 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CYLDQ9NQC7 956 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SYBUQ9NX95 663 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GALNT8Q9NY28 637 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PSAT1Q9Y617 370 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HMX2A2RU54 273 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GRM6O15303 877 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ATP9BO43861 1147 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ACRP10323 421 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TPSB2P20231 275 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PRKCHP24723 683 aa7.14□□□□□ -1.27
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