RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF202	O95125	648 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	PEX11B	O96011	259 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	FES	P07332	822 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TSPY3	P0CV98	308 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TSPY8	P0CW00	308 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM225B	P0DP42	221 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SCG2	P13521	617 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	PFKFB1	P16118	471 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	CAPN3	P20807	821 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	KRT2	P35908	639 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	GNAQ	P50148	359 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	NDUFA8	P51970	172 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	FOXL2	P58012	376 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TRPC3	Q13507	836 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	DNASE1L3	Q13609	305 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	PTPRR	Q15256	657 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TBCC	Q15814	346 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	STX1A	Q16623	288 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	AAK1	Q2M2I8	961 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	RINL	Q6ZS11	566 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SYT13	Q7L8C5	426 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TTC30A	Q86WT1	665 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	USP38	Q8NB14	1042 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	CXorf38	Q8TB03	319 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	HMGB4	Q8WW32	186 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	5.81	□□□□□ -1.48	4e-6	■□□□□ 8.2
ZNF638-223	ENST00000492262	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	LOXL4	Q96JB6	756 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	PRR25	Q96S07	402 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	KAT14	Q9H8E8	782 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	CHODL	Q9H9P2	273 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	KLC4	Q9NSK0	619 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SWAP70	Q9UH65	585 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	RCE1	Q9Y256	329 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	WDR90	Q96KV7	1748 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	RLF	Q13129	1914 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	CYTH3	O43739	400 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	KRT38	O76015	456 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	BMP15	O95972	392 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	ATP1A3	P13637	1013 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	DRD1	P21728	446 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	CTGF	P29279	349 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	DGKQ	P52824	942 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	DEUP1	Q05D60	604 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC12A1	Q13621	1099 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	DLGAP5	Q15398	846 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	GALNT17	Q6IS24	598 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	NME8	Q8N427	588 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TEKT1	Q969V4	418 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	IDI2	Q9BXS1	227 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	ANO10	Q9NW15	660 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	PIPSL	A2A3N6	862 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ZNF638-223	ENST00000492262	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		5.79	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms