RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 REV3LO60673 3130 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 C5orf60A6NFR6 353 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 FAM187AA6NFU0 413 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 PRRT4C9JH25 899 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 J3KR12 359 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 K7EQS6 105 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SMAPO00193 183 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SNAP91O60641 907 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RNF40O75150 1001 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 TMCC1O94876 653 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MAP3K6O95382 1288 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 EGFP01133 1207 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 JCHAINP01591 159 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SRCP12931 536 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 HOXB2P14652 356 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RBL1P28749 1068 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SCNN1BP51168 640 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CCR3P51677 355 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CLCN5P51795 746 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GEMP55040 296 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ARF5P84085 180 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB16Q05516 673 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 BCL2L1Q07817 233 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CCINQ13939 588 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CYP1B1Q16678 543 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 PARP6Q2NL67 630 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GAB4Q2WGN9 574 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 C8orf74Q6P047 294 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 LINGO4Q6UY18 593 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00523Q86TU6 105 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MAML1Q92585 1016 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ALG14Q96F25 216 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 IFT43Q96FT9 208 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 LMLNQ96KR4 655 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA13Q96N96 652 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 AGAP3Q96P47 875 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 NT5MQ9NPB1 228 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 VPS45Q9NRW7 570 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 IL36AQ9UHA7 158 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 VCANP13611 3396 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 KRBA1A5PL33 1030 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM221A6NGB7 291 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 M0R296 226 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 KCNK1O00180 336 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 INSIG1O15503 277 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 GCATO75600 419 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ZMPSTE24O75844 475 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ADH1BP00325 375 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 DNTTP04053 509 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CHRNB1P11230 501 aa9.89□□□□□ -0.83
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CTPS1-210ENST00000486889 EPHB1P54762 984 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CALCOCO2Q13137 446 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 LAMB3Q13751 1172 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SLC14A2Q15849 920 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SYT13Q7L8C5 426 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PGBD3Q8N328 593 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.89□□□□□ -0.83
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