RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	CER1	O95813	267 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-34	P06331	123 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	GK	P32189	559 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	VSTM4	Q8IW00	320 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	KLK6	Q92876	244 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ARRDC3	Q96B67	414 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	MYOC	Q99972	504 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	CEP44	Q9C0F1	390 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	DONSON	Q9NYP3	566 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ACACB	O00763	2458 aa		15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPC4	97 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880		H3BRJ5	948 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	MYO1F	O00160	1098 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK3	O14649	394 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	GIPC1	O14908	333 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A4	O43246	635 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	TMCC1	O94876	653 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ARL4A	P40617	200 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	RHOA	P61586	193 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	KRT81	Q14533	505 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	PARP15	Q460N3	678 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	AGBL4	Q5VU57	503 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	RFX8	Q6ZV50	586 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	TMIE	Q8NEW7	156 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SKA1	Q96BD8	255 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	EXOC2	Q96KP1	924 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC42	Q96M95	316 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	KLC2	Q9H0B6	622 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SP110	Q9HB58	689 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	IL21R	Q9HBE5	538 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		15.07	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	NEMP1	O14524	444 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	MFAP3L	O75121	409 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	IGSF6	O95976	241 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	CYP1A2	P05177	515 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	UGT2B4	P06133	528 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	TCF4	P15884	667 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ERCC2	P18074	760 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	HTR7	P34969	479 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	CCR5	P51681	352 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	NEK3	P51956	506 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	RAD51	Q06609	339 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA3B	Q13214	749 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	KIF19	Q2TAC6	998 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-B	Q31612	363 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		15.06	■□□□□ 0
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQU0	124 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	RNF103	O00237	685 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	SLC31A1	O15431	190 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	PRLR	P16471	622 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	CD38	P28907	300 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	PCK1	P35558	622 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	GRIA4	P48058	902 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	NDST2	P52849	883 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	IL9R	Q01113	521 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	SERINC3	Q13530	473 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	STAT4	Q14765	748 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	ACAP1	Q15027	740 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	SLC18A3	Q16572	532 aa		15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	BOLA3	Q53S33	107 aa		15.05	■□□□□ -0

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms