RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	USP17L23	D6RBM5	183 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CSPG5	O95196	566 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZBED6	P86452	979 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SEMA3A	Q14563	771 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPA	Q15257	358 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXO43	Q4G163	708 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM47B	Q8NA70	645 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	POC5	Q8NA72	575 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf74	Q96LT6	269 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	WDFY2	Q96P53	400 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FRG2B	Q96QU4	278 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	APOL6	Q9BWW8	343 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10A4	Q9H209	315 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZWILCH	Q9H900	591 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378		A8MZ25	164 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNJ18	B7U540	433 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SNAP23	O00161	211 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	LIAS	O43766	372 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	NDUFS3	O75489	264 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HSPA4L	O95757	839 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC2A4	P14672	509 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GLUL	P15104	373 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PTMS	P20962	102 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	UBA7	P41226	1012 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP4F2	P78329	520 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RHAG	Q02094	409 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	IRF3	Q14653	427 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP2R5B	Q15173	497 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HECTD3	Q5T447	861 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MOB3C	Q70IA8	216 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	AVL9	Q8NBF6	648 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KAT2B	Q92831	832 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CAVIN3	Q969G5	261 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF347	Q96SE7	839 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ICK	Q9UPZ9	632 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	WIZ	O95785	1651 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378		K7ESM1	405 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SCAMP1	O15126	338 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ENTPD3	O75355	529 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2C1	O95371	312 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PRR35	P0CG20	571 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	DRD4	P21917	467 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CHRNA5	P30532	468 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	NRIP1	P48552	1158 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC14A1	Q13336	389 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GALNT3	Q14435	633 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RPE65	Q16518	533 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CEP85	Q6P2H3	762 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RFX6	Q8HWS3	928 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF653	Q96CK0	615 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ASAH2	Q9NR71	780 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MRGBP	Q9NV56	204 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ASIC5	Q9NY37	505 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		6.25	□□□□□ -1.41

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