RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	GPR34	Q9UPC5	381 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	CLIC4	Q9Y696	253 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	IGLON5	A6NGN9	336 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504		M0QYT0	321 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	ENDOD1	O94919	500 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	DDAH2	O95865	285 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	UGT1A3	P35503	534 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	GCLM	P48507	274 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	RAD23B	P54727	409 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	PPARD	Q03181	441 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	PTK2B	Q14289	1009 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	HID1	Q8IV36	788 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	CHST14	Q8NCH0	376 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC114	Q96M63	670 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	RDH14	Q9HBH5	336 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	HESX1	Q9UBX0	185 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-222	ENST00000449504	WIPF3	A6NGB9	483 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504		F5H5T6	163 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504		K7ERQ8	282 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	NEMP1	O14524	444 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	RAD1	O60671	282 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	MT-CO1	P00395	513 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	APOE	P02649	317 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	LTF	P02788	710 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PRNP	P04156	253 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	SRC	P12931	536 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CD19	P15391	556 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PDC	P20941	246 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CASP1	P29466	404 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ARSD	P51689	593 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	NEK3	P51956	506 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PLK1	P53350	603 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PFN3	P60673	137 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CDC20	Q12834	499 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGEF7	Q14155	803 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ELOC	Q15369	112 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	AMZ1	Q400G9	498 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	MAP9	Q49MG5	647 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TMIE	Q8NEW7	156 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TAAR9	Q96RI9	348 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	EPAS1	Q99814	870 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	MIS12	Q9H081	205 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CDH19	Q9H159	772 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TNMD	Q9H2S6	317 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CISH	Q9NSE2	258 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	DONSON	Q9NYP3	566 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	VPS28	Q9UK41	221 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	FBN2	P35556	2912 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	IKBKB	O14920	756 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	LEFTY1	O75610	366 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ALPI	P09923	528 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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