RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM62Q9BVG3 475 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A5Q9BY07 1137 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 MUC3BQ9H195 1237 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 VPS51Q9UID3 782 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 RABGEF1Q9UJ41 708 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 E5RJQ4 531 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 FPGTO14772 594 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CNTN5O94779 1100 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 LIPCP11150 499 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 GP1BBP13224 206 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ADRB3P13945 408 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 WT1P19544 449 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PFN3P60673 137 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 KRT83P78385 493 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PRRT3Q5FWE3 981 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 LINGO4Q6UY18 593 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 VASH2Q86V25 355 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PPM1KQ8N3J5 372 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35C1Q96A29 364 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 NT5C1BQ96P26 610 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 FOXP3Q9BZS1 431 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CLPBQ9H078 707 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 THAP9Q9H5L6 903 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 FAM204AQ9H8W3 233 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 DDIT4Q9NX09 232 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP45Q9UL16 551 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 HS3ST4Q9Y661 456 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 WASF2Q9Y6W5 498 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SCN8AQ9UQD0 1980 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 YY2O15391 372 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PPFIA2O75334 1257 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN11O75508 207 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ENDOD1O94919 500 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA6P08133 673 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SLC2A3P11169 496 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CCR1P32246 355 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CLCA4Q14CN2 919 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 MANEAQ5SRI9 462 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PHACTR4Q8IZ21 702 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB106AQ8N104 65 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 HTR3CQ8WXA8 447 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R16AQ96I34 528 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC61Q9BV99 259 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A18Q9H1K4 315 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PISDQ9UG56 409 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SEPT3Q9UH03 358 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 FLNCQ14315 2725 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 IGLON5A6NGN9 336 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 LMO7DNF2Z398 122 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 RHOCP08134 193 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 L1CAMP32004 1257 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SYKP43405 635 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFA8P51970 172 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CDH4P55283 916 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CCL7P80098 99 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf22Q49AR2 442 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ALFQ53S48 1182 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ATL3Q6DD88 541 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 C22orf39Q6P5X5 142 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 RRAGAQ7L523 313 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM110Q86TL2 294 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 STK32AQ8WU08 396 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 MED15Q96RN5 788 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 GULP1Q9UBP9 304 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 RELNP78509 3460 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0D9SEW6 157 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PQM1 296 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 AGRPO00253 132 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 NVLO15381 856 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 TSHRP16473 764 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ITIH1P19827 911 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 FMO5P49326 533 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CDK17Q00537 523 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SGCGQ13326 291 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ZFAND4Q86XD8 727 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF19Q8IW93 802 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC74AQ96AQ1 378 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 STRADBQ9C0K7 418 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 SIK2Q9H0K1 926 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXD12-201ENST00000404162 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms