RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MUC3BQ9H195 1237 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CBX4O00257 560 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CHN1P15882 459 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PGAM1P18669 254 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 KRT15P19012 456 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 STX2P32856 288 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 NPY2RP49146 381 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CDH17Q12864 832 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PRSS36Q5K4E3 855 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 LINGO4Q6UY18 593 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RANBP10Q6VN20 620 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TRABD2AQ86V40 505 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SLC44A1Q8WWI5 657 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ATP2A3Q93084 1043 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MFSD3Q96ES6 412 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF778Q96MU6 729 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TLE6Q9H808 572 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SPAG7O75391 227 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CD160O95971 181 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ERVK-10P10266 1014 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 BRAFP15056 766 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 AVPR1AP37288 418 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 NRIP1P48552 1158 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TNK2Q07912 1038 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CRYMQ14894 314 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CYTH1Q15438 398 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00523Q86TU6 105 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RNF135Q8IUD6 432 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MZB1Q8WU39 189 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SAMD11Q96NU1 681 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA3CQ99985 751 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TASP1Q9H6P5 420 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 FETUBQ9UGM5 382 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 BPTFQ12830 3046 aa15.58■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 FAM159BA6NKW6 160 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH1A2O94788 518 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 GSTA2P09210 222 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 NMBRP28336 390 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 RGRP47804 291 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ARF5P84085 180 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 MPP3Q13368 585 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 POU6F1Q14863 301 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 RTL10Q7L3V2 364 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC6Q86X45 466 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 APCDD1Q8J025 514 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 VN1R2Q8NFZ6 395 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ITFG1Q8TB96 612 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 TRABDQ9H4I3 376 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 XYLBO75191 536 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 PRAMEF12O95522 483 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 POLBP06746 335 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 CEBPBP17676 345 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5DP30049 168 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 HOXA9P31269 272 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 CSKP41240 450 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF235Q14590 738 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 RASA2Q15283 850 aa15.57■□□□□ 0.08
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms