RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 CLEC20AQ6ZU45 233 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 HMGCLL1Q8TB92 370 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 DTNBP1Q96EV8 351 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 GPR78Q96P69 363 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 RHOJQ9H4E5 214 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 Q9H521 79 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 GDAP2Q9NXN4 497 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 STAP1Q9ULZ2 295 aa19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 CCDC160A6NGH7 325 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 YJEFN3A6XGL0 299 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 KCNU1A8MYU2 1149 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 PYGLP06737 847 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 PCSK6P29122 969 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TKTL1P51854 596 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 LIMS2Q7Z4I7 341 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ZNF410Q86VK4 478 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 CCNYL1Q8N7R7 359 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 RDH11Q8TC12 318 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 USP33Q8TEY7 942 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ATP6V1E2Q96A05 226 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 NXNL1Q96CM4 212 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SGF29Q96ES7 293 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 FTHL17Q9BXU8 183 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SLC2A11Q9BYW1 496 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SDHDO14521 159 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TADA2AO75478 443 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 DDHD2O94830 711 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TNFAIP8O95379 198 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 APOA4P06727 396 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 HDCP19113 662 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 MAP3K7CLP57077 242 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 CTBP1Q13363 440 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 HERC3Q15034 1050 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ZNF280DQ6N043 979 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 AMIGO2Q86SJ2 522 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TMEM126BQ8IUX1 230 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ULBP1Q9BZM6 244 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 PCDHAC1Q9H158 963 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 LRRC4Q9HBW1 653 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 CACNG4Q9UBN1 327 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 PHF24Q9UPV7 400 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa19.06■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 NEMP2A6NFY4 417 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SLC22A2O15244 555 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 JCHAINP01591 159 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 NPY2RP49146 381 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 MAP7Q14244 749 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 CNTD1Q8N815 330 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SNX31Q8N9S9 440 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SPATA22Q8NHS9 363 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 FAM81AQ8TBF8 368 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 DPF3Q92784 378 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 EFCAB1Q9HAE3 211 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TMEM30AQ9NV96 361 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 MID2Q9UJV3 735 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 C7orf72A4D263 438 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 GPR32O75388 356 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 GALNT2Q10471 571 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 NRF1Q16656 503 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 CNSTQ6PJW8 725 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 HDAC11Q96DB2 347 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 FIS1Q9Y3D6 152 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa19.05■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ASB14A6NK59 587 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TRPA1O75762 1119 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 FAM58BPP0C7Q3 252 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 NELFEP18615 380 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TAF6P49848 677 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SLC12A1Q13621 1099 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 PTK2BQ14289 1009 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 DGKDQ16760 1214 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 USP41Q3LFD5 358 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D25Q3MII6 688 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 MGAT5BQ3V5L5 792 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 SH2D4BQ5SQS7 431 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ADA2Q9NZK5 511 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 VTI1BQ9UEU0 232 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 RNF11Q9Y3C5 154 aa19.04■□□□□ 0.64
CITED2-201ENST00000367651 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms