RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2E3Q969T4 207 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 A0A088AWK7 358 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KPNA5O15131 536 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 EPN2O95208 641 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KLRG1Q96E93 195 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TPD52L3Q96J77 140 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 YDJCA8MPS7 323 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 HS6ST1O60243 411 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FAM20BO75063 409 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MLYCDO95822 493 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SNHG28P0DPA3 235 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 BST1Q10588 318 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FUKQ8N0W3 1084 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL3Q9UH77 587 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DERAQ9Y315 318 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DISP2A7MBM2 1401 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3R1P27986 724 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 NOS3P29474 1203 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CEP78Q5JTW2 689 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DOK6Q6PKX4 331 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf29Q8N999 325 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 LGMNQ99538 433 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP16Q9BY84 665 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ALOX15BO15296 676 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R40P59535 323 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP1BP68106 108 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ECM1Q16610 540 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 HELQQ8TDG4 1101 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 LHX5Q9H2C1 402 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SNX6Q9UNH7 406 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PPLO60437 1756 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 AIF1P55008 147 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRNQ16849 979 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ALG3Q92685 438 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RORBQ92753 470 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RNFT2Q96EX2 444 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ASAH2Q9NR71 780 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 H3BN98 237 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FSBPO95073 299 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CD52P31358 61 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PKNOX1P55347 436 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SP3Q02447 781 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CREMQ03060 361 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 POTEHQ6S545 545 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FAM35AQ86V20 835 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PROX1Q92786 737 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PSME2Q9UL46 239 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 B4GALT4O60513 344 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 COX7A2P14406 83 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MMP8P22894 467 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 EVX2Q03828 476 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 USP41Q3LFD5 358 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC3O15379 428 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA2BP08514 1039 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FGD3Q5JSP0 725 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 QSOX1O00391 747 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM24O15164 1050 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 UNC5CO95185 931 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RAB10P61026 200 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms