RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356713.4

CNNM1-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM1, Length 5,959 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1-201ENST00000356713 LGALS2P05162 132 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 RPTNQ6XPR3 784 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 DMPKQ09013 629 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 RBBP4Q09028 425 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 WDR59Q6PJI9 974 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 KRT74Q7RTS7 529 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CCDC166P0CW27 439 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 TSPAN8P19075 237 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ADRA1DP25100 572 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ABRQ12979 859 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 NDUFA5Q16718 116 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ASB2Q96Q27 587 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 BTRCQ9Y297 605 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 IDH3BO43837 385 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 KDELR1P24390 212 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CES5AQ6NT32 575 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CDH24Q86UP0 819 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 AHI1Q8N157 1196 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 DNAJC18Q9H819 358 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 SGTAO43765 313 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 GCNT1Q02742 428 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 PARGQ86W56 976 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 GSAPA4D1B5 854 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 NAB1Q13506 487 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 SLC25A12O75746 678 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 MYBPC1Q00872 1141 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 PCID2Q5JVF3 399 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 OR10G6Q8NH81 332 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 NEPROQ6NW34 567 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CNSTQ6PJW8 725 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 MTFR1LQ9H019 292 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CTNNB1P35222 781 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 C21orf59P57076 290 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CDC42P60953 191 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CYP4F2P78329 520 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 DLG4P78352 724 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CYP4F3Q08477 520 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF844Q08AG5 666 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CDK7P50613 346 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ARF5P84085 180 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ALG11Q2TAA5 492 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ZMPSTE24O75844 475 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 APOC2P02655 101 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 HNMTP50135 292 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 TSC22D1Q15714 1073 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 MZT2AQ6P582 158 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 FAM124AQ86V42 546 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 AP3D1O14617 1153 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 WNT8BQ93098 351 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 VPS35Q96QK1 796 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CXCL11O14625 94 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 MGRN1O60291 552 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 STX11O75558 287 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 IL1BP01584 269 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 ALADP13716 330 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM1-201ENST00000356713 CTPS1P17812 591 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms