RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TM7SF2O76062 418 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DPA1P20036 260 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PTPAQ15257 358 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TIFAQ96CG3 184 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HES6Q96HZ4 224 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CENPOQ9BU64 300 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NUAK2Q9H093 628 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CALML5Q9NZT1 146 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MED11Q9P086 117 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PSME2Q9UL46 239 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ANGPT4Q9Y264 503 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 LRP6O75581 1613 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FAM172BPA6NC97 362 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL33A6NCF5 533 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 UBXN8O00124 270 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MDM4O15151 490 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NBNO60934 754 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF15O94989 841 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CCNB1P14635 433 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PON1P27169 355 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SLCO1A2P46721 670 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GRIK2Q13002 908 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 LAPTM5Q13571 262 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2SQ16763 222 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 COQ5Q5HYK3 327 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FAM91A1Q658Y4 838 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 IYDQ6PHW0 289 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PGAP1Q75T13 922 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DOCK2Q92608 1830 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 C4AP0C0L4 1744 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 C4BP0C0L5 1744 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 LOC100653049A0A140TA62 436 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GLTPD2A6NH11 291 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AQP12BA6NM10 295 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN25C9JDP6 229 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CLOCKO15516 846 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 C8BP07358 591 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SERPINF2P08697 491 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 STOMP27105 288 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RPL14P50914 215 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TMBIM6P55061 237 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 KDSRQ06136 332 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF181Q2M3W8 571 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BORAQ6PGQ7 559 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RINLQ6ZS11 566 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 WNK4Q96J92 1243 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PAFAH2Q99487 392 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 EGFL8Q99944 293 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RRAGCQ9HB90 399 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TBX20Q9UMR3 447 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 M0QYV0 167 aa4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms