RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 LINGO4Q6UY18 593 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 CHST14Q8NCH0 376 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 OR7D4Q8NG98 312 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 SPON2Q9BUD6 331 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 CALN1Q9BXU9 219 aa21.54■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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SOCS1-201ENST00000332029 DAB2P98082 770 aa21.53■■□□□ 1.04
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SOCS1-201ENST00000332029 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC14Q49A88 953 aa21.53■■□□□ 1.04
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SOCS1-201ENST00000332029 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.53■■□□□ 1.04
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SOCS1-201ENST00000332029 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.53■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.53■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.53■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.53■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 BPTFQ12830 3046 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 FFAR2O15552 330 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 BRINP1O60477 761 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 PCDH8O95206 1070 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 ADRA1BP35368 520 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 UBXN1Q04323 297 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 PTP4A2Q12974 167 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 ARSIQ5FYB1 569 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 RETSATQ6NUM9 610 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 OR13H1Q8NG92 308 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 HDAC8Q9BY41 377 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 PRORYQ9H606 182 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 IL36AQ9UHA7 158 aa21.52■■□□□ 1.04
SOCS1-201ENST00000332029 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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SOCS1-201ENST00000332029 ZMPSTE24O75844 475 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 GJB6O95452 261 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 PTPN9P43378 593 aa21.51■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 CLDN2P57739 230 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 GNA12Q03113 381 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 SLC20A2Q08357 652 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 DRC7Q8IY82 874 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 FGF11Q92914 225 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.51■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 LEFTY1O75610 366 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 PIAS2O75928 621 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 MT-CO3P00414 261 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 KRT3P12035 628 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 TMC6Q7Z403 805 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ALPPL2P10696 532 aa21.49■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 CKMT1AP12532 417 aa21.49■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ACTN2P35609 894 aa21.49■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 NEK3P51956 506 aa21.49■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ARF5P84085 180 aa21.49■■□□□ 1.03
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