RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 PANX3Q96QZ0 392 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SEPHS2Q99611 448 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TMEM114B3SHH9 223 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PCDH8O95206 1070 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 EML3Q32P44 896 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TBCELQ5QJ74 424 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SH3GL1Q99961 368 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SH3GL3Q99963 347 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 HDAC3O15379 428 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ZMPSTE24O75844 475 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 LRIG2O94898 1065 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 RANBP1P43487 201 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 STK40Q8N2I9 435 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 DEFB118Q96PH6 123 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 RGPD5Q99666 1765 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 USP1O94782 785 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 GPC1P35052 558 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SLC5A3P53794 718 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TWNKQ96RR1 684 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TTPALQ9BTX7 342 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 OR56A5P0C7T3 313 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PCNAP12004 261 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TPSB2P20231 275 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 MAP3K10Q02779 954 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TPSAB1Q15661 275 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SEC22BO75396 215 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ATP6V1B2P21281 511 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ERAP2Q6P179 960 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TEPSINQ96N21 525 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ASB2Q96Q27 587 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CLUHO75153 1309 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TBL1XO60907 577 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 XYLBO75191 536 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ZNF682O95780 498 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 MLNP12872 115 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CYP3A5P20815 502 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CYP2A7P20853 494 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 LRRC8BQ6P9F7 803 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 MED8Q96G25 268 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 MARK4Q96L34 752 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CORO1BQ9BR76 489 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SDCBP2Q9H190 292 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 HPS4Q9NQG7 708 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SCN3BQ9NY72 215 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 GMIPQ9P107 970 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 OPTCQ9UBM4 332 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 KDM1AO60341 852 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SPOCK2Q92563 424 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 RHOJQ9H4E5 214 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ARL15Q9NXU5 204 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 CREB1P16220 341 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 C10orf107Q8IVU9 208 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 RIN3Q8TB24 985 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 AGAP11Q8TF27 550 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
EHD3-201ENST00000322054 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms