RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 P3H2Q8IVL5 708 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MIER2Q8N344 545 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ACADSP16219 412 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ASPAP45381 313 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 C16orf87Q6PH81 154 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 BATF3Q9NR55 127 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MFSD11O43934 449 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FGF1P05230 155 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CES1P23141 567 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 DSG1Q02413 1049 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NDNQ99608 321 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 LMO2P25791 158 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TGM3Q08188 693 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CROTQ9UKG9 612 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SYN3O14994 580 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 VPS4BO75351 444 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CLDN11O75508 207 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PTPRNQ16849 979 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 RAD18Q9NS91 495 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FKBP6O75344 327 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CTBP1Q13363 440 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ZNF516Q92618 1163 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MTA2O94776 668 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 EOMESO95936 686 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CATP04040 527 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 HLA-DPA1P20036 260 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 GALNT3Q14435 633 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TMEM192Q8IY95 271 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SHISA4Q96DD7 197 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 RAB10P61026 200 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SCN3BQ9NY72 215 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CLUHO75153 1309 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 RPN2P04844 631 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 IGFBP4P22692 258 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PRMT2P55345 433 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PFKPQ01813 784 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CBX6O95503 412 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TFEBP19484 476 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TMEM237Q96Q45 408 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MRASO14807 208 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SNX32Q86XE0 403 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 HDAC10Q969S8 669 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TEPSINQ96N21 525 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SNX3O60493 162 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PIF1Q9H611 641 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CD248Q9HCU0 757 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 VPS45Q9NRW7 570 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PADI4Q9UM07 663 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms