RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 ARNTP27540 789 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 RAP1GDS1P52306 607 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 MXRA7P84157 204 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SP3Q02447 781 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 EFEMP1Q12805 493 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CTBP1Q13363 440 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 RDH11Q8TC12 318 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 OXSMQ9NWU1 459 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 RHOQP17081 205 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 AVPR1AP37288 418 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 MAGEA11P43364 429 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 NDST2P52849 883 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 MPP1Q00013 466 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SLC12A1Q13621 1099 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 LCA5Q86VQ0 697 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 GPR152Q8TDT2 470 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 FAM161BQ96MY7 647 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CDH19Q9H159 772 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PLXNA3P51805 1871 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PAMP19021 973 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CHRNA4P43681 627 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 WNT3AP56704 352 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SEPT6Q14141 434 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CNGA3Q16281 694 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PCSK7Q16549 785 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CFAP157Q5JU67 520 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF570Q96NI8 536 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 C1orf21Q9H246 121 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TREX1Q9NSU2 369 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TK2O00142 265 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PEX11BO96011 259 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 POLD2P49005 469 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 RENBPP51606 427 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PGGT1BP53609 377 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 USP4Q13107 963 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PSMD5Q16401 504 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 KDELC1Q6UW63 502 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 HMCESQ96FZ2 354 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SCYL1Q96KG9 808 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TM7SF2O76062 418 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 COL6A2P12110 1019 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ELF1P32519 619 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SLC1A2P43004 574 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 STMN2Q93045 179 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 COG4Q9H9E3 785 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 NT5MQ9NPB1 228 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 IL37Q9NZH6 218 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 ACOT9Q9Y305 439 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 KRT36O76013 467 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 CNTN5O94779 1100 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 DNAJB1P25685 340 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 YWHAQP27348 245 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 GLRBP48167 497 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 RAB10P61026 200 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL16-201ENST00000293778 RCN1Q15293 331 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms