RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 GAB3Q8WWW8 586 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 RBBP8Q99708 897 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 EP400Q96L91 3159 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 HUS1O60921 280 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TADA2AO75478 443 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TPSB2P20231 275 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MPP1Q00013 466 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TPSAB1Q15661 275 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NFKBIAP25963 317 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NR2C2P49116 596 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 KCTD2Q14681 263 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 RMI1Q9H9A7 625 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SPC25Q9HBM1 224 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PCNTO95613 3336 aa15.5■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NFASCO94856 1347 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MAN1A2O60476 641 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 RGS20O76081 388 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SMIM18P0DKX4 95 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 KIZQ2M2Z5 673 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ABHD8Q96I13 439 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 RNF145Q96MT1 663 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 KCNH1O95259 989 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 APOA4P06727 396 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NDST2P52849 883 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF280DQ6N043 979 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC29A1Q99808 456 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SUN2Q9UH99 717 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TTC36A6NLP5 189 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 H3BNX3 289 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 GSTA4O15217 222 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 GCATO75600 419 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 AKAP5P24588 427 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NMBRP28336 390 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 LIMK2P53671 638 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NCLNQ969V3 563 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MRIQ9BWK5 157 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SNTG2Q9NY99 539 aa15.49■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CFAP99D6REC4 459 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TOR1BO14657 336 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 METTL21CQ5VZV1 264 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FICDQ9BVA6 458 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SIX4Q9UIU6 781 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CLDN5O00501 218 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 L1CAMP32004 1257 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ARRB2P32121 409 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 IKBKEQ14164 716 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TRNP1Q6NT89 227 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 BEST2Q8NFU1 509 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms