RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 RHOQP17081 205 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 ACP1P24666 158 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN9P43378 593 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 SLC25A45Q8N413 288 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 NXPE2Q96DL1 559 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 CALN1Q9BXU9 219 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 FZD3Q9NPG1 666 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 KRT3P12035 628 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ADRB3P13945 408 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 DGKAP23743 735 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 E2F1Q01094 437 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PROX2Q3B8N5 592 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 HES3Q5TGS1 186 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 MANEALQ5VSG8 457 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PDZD3Q86UT5 571 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 OR13H1Q8NG92 308 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 GPT2Q8TD30 523 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 IFT43Q96FT9 208 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 LRIG1Q96JA1 1093 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEH1Q9H213 219 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FANCLQ9NW38 375 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 DNAI1Q9UI46 699 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 A6NNZ2 444 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM38O00635 465 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SIGLEC6O43699 453 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 AP1G1O43747 822 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CD160O95971 181 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ACVRL1P37023 503 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CLDN2P57739 230 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RAB6CQ53S08 254 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 Q6ZSR6 202 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NLRP14Q86W24 1093 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 OR4C6Q8NH72 309 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RAB7BQ96AH8 199 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 A0A087WV48 116 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 EPHB6O15197 1021 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 LRIG2O94898 1065 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CALB1P05937 261 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CLDN6P56747 220 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 DAB2P98082 770 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PTP4A2Q12974 167 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SYCP1Q15431 976 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NEK11Q8NG66 645 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NTAN1Q96AB6 310 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 AK5Q9Y6K8 562 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 LAMA5O15230 3695 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NEMP2A6NFY4 417 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FAM72CH0Y354 149 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 TSPAN6O43657 245 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RAMP2O60895 175 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PIAS2O75928 621 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms