RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPRN2Q92932 1015 aa24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 AZIN2Q96A70 460 aa24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 GKN1Q9NS71 199 aa24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 DCDC2Q9UHG0 476 aa24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 TCAF1Q9Y4C2 921 aa24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 INSL5Q9Y5Q6 135 aa24.29■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 TIMM44O43615 452 aa24.28■■□□□ 1.48
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RPUSD1-201ENST00000007264 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 DSC2Q02487 901 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF235Q14590 738 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF43Q68DV7 783 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 TCEAL8Q8IYN2 117 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC25A41Q8N5S1 370 aa24.28■■□□□ 1.48
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RPUSD1-201ENST00000007264 C2orf78A6NCI8 922 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEA9P43362 315 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINB8P50452 374 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 TNK2Q07912 1038 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 DCLK2Q8N568 766 aa24.28■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
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RPUSD1-201ENST00000007264 CHRNA4P43681 627 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 CREMQ03060 361 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 GNA12Q03113 381 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 IL31Q6EBC2 164 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDCD3Q8IVD9 361 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF38Q9H0F5 515 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX15Q9NRS6 342 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 MAFFQ9ULX9 164 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.27■■□□□ 1.48
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBBXA8MT70 800 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CLDN11O75508 207 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ALDH3A1P30838 453 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 ITIH5Q86UX2 942 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 BBS5Q8N3I7 341 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF599Q96NL3 588 aa24.26■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.26■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PPM1EQ8WY54 764 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.26■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.26■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 NPHS2Q9NP85 383 aa24.26■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 H0YHG0 523 aa24.25■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 TEX28O15482 410 aa24.25■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 VAPBO95292 243 aa24.25■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 E2F7Q96AV8 911 aa24.25■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 HEATR9A2RTY3 570 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF18O76093 207 aa24.25■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 TMPRSS15P98073 1019 aa24.25■■□□□ 1.47
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RPUSD1-201ENST00000007264 UGP2Q16851 508 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 INSCQ1MX18 579 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PGBD5Q8N414 524 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS39Q96JC1 886 aa24.25■■□□□ 1.47
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