RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nlrc5C3VPR6 1915 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zfp383A0A087WRR7 490 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A0A286YDG0 184 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 1700001O22RikA2APZ1 375 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Glt1d1A4FUP9 346 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10376D3YXI8 184 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10718D3Z1I7 227 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm3543D3Z235 184 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam170bE9PXT9 378 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Erich2E9Q1A6 463 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm4181E9Q7X3 184 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r86L7N213 316 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10375L7N286 184 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm3573L7N292 184 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Psmb1O09061 240 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dusp8O09112 663 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Clk3O35492 638 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prl7a2O54831 253 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Amy1P00687 511 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 H2-Q10P01898 325 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CryabP23927 175 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Il15P48346 162 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rps13P62301 151 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 YwhazP63101 245 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kif20aP97329 887 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atp8a2P98200 1148 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cep76Q0VEJ0 659 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnf133Q14B02 382 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Klra9Q2TJJ8 266 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CdonQ32MD9 1250 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kcnh6Q32ME0 950 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 GsapQ3TCV3 858 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pde12Q3TIU4 608 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rufy4Q3TYX8 563 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mylk3Q3UIZ8 795 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pydc3Q3V3Q4 588 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cfhr2Q4LDF6 332 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 R3hdm4Q4VBF2 262 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam189bQ5HZJ5 669 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Islr2Q5RKR3 745 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rabl6Q5U3K5 725 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sh3gl2Q62420 352 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Itga2Q62469 1178 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ugt1a1Q63886 535 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Styk1Q6J9G1 429 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pptc7Q6NVE9 310 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Snx19Q6P4T1 997 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Naif1Q6PFD7 327 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm5771Q792Y9 245 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rtn4rl2Q7M6Z0 420 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ffar4Q7TMA4 361 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Me3Q8BMF3 604 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Scfd2Q8BTY8 684 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cndp1Q8BUG2 492 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp43Q8BUM9 1132 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Amz1Q8BVF9 502 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atg16l1Q8C0J2 607 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Med19Q8C1S0 244 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cabs1Q8C633 391 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 C1rbQ8CFG9 706 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fbxl8Q8CIG9 374 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pkn3Q8K045 878 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nek9Q8K1R7 984 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AamdcQ8R0P4 122 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Iffo2Q8R2V2 512 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1324Q8VEU7 332 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1208Q8VG47 308 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dhx36Q8VHK9 1001 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zcchc14Q8VIG0 956 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 VillQ91YD6 859 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hdac9Q99N13 588 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NenfQ9CQ45 171 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prr23a3Q9CWP9 254 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tubb4aQ9D6F9 444 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 1700001F09RikQ9DAR5 184 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 IgtpQ9DCE9 423 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tceal9Q9DD24 104 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r100Q9EPS5 307 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Akr1a1Q9JII6 325 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Neu2Q9JMH3 379 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Egfl7Q9QXT5 275 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 GdaQ9R111 454 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Psma4Q9R1P0 261 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cited4Q9WUL8 182 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Coro1cQ9WUM4 474 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mzf1S4R1L6 814 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Znf536Q8K083 1302 aa2.36□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ighv1-34A0A075B5V2 117 aa2.35□□□□□ -2.03
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn2r94E9PZK8 818 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.3 ms