RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	FEM1C	Q96JP0	617 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	HAPLN3	Q96S86	360 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	HDAC8	Q9BY41	377 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		15	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DRGX	A6NNA5	263 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DGKA	P23743	735 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	SDC4	P31431	198 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ACTN2	P35609	894 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	GABRB2	P47870	512 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	TAS2R38	P59533	333 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP11A	P98196	1134 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	GNA12	Q03113	381 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	SYCP1	Q15431	976 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF284	Q2VY69	593 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	NAA35	Q5VZE5	725 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	OR13H1	Q8NG92	308 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4C6	Q8NH72	309 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	TSC1	Q92574	1164 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	C10orf142	B7Z368	130 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	MT-CO3	P00414	261 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ADRB3	P13945	408 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	UCHL3	P15374	230 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DES	P17661	470 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ITGB7	P26010	798 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	FLT3	P36888	993 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CLDN2	P57739	230 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CDO1	Q16878	200 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	PROX2	Q3B8N5	592 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CARD16	Q5EG05	197 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZSR6	202 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF677	Q86XU0	584 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM38	O00635	465 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	FPGT	O14772	594 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	PIAS2	O75928	621 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	MME	P08473	750 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	RABIF	P47224	123 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	RTP5	Q14D33	572 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	C2CD6	Q53TS8	623 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	PARG	Q86W56	976 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	FGF11	Q92914	225 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	NT5C3B	Q969T7	300 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	IFT43	Q96FT9	208 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	LGMN	Q99538	433 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	STK33	Q9BYT3	514 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	USP29	Q9HBJ7	922 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD62	A6NC57	917 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599		F8VZ95	297 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	BRINP1	O60477	761 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	PLXNA2	O75051	1894 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	L1CAM	P32004	1257 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TARDBP-231	ENST00000639599	MAPKAPK2	P49137	400 aa		14.96	□□□□□ -0.01

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