RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB14	O43829	449 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ACADS	P16219	412 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CHRNA4	P43681	627 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CUL3	Q13618	768 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PCSK7	Q16549	785 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	DPF3	Q92784	378 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	IRAK2	O43187	625 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN15	O75808	1086 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ANPEP	P15144	967 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB5	P36952	375 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NAGLU	P54802	743 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT6	Q14141	434 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CNGA3	Q16281	694 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ANO4	Q32M45	955 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	OMD	Q99983	421 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152		F8W8V4	182 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K7	O43318	606 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	MAFK	O60675	156 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	EPHA3	P29320	983 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	GRIA4	P48058	902 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TUB	P50607	506 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	IRF5	Q13568	498 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CCR1	P32246	355 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	COG7	P83436	770 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM32	Q13049	653 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	BIRC2	Q13490	618 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	EML3	Q32P44	896 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	GPR22	Q99680	433 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NUF2	Q9BZD4	464 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	OXSM	Q9NWU1	459 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SCN4A	P35499	1836 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DQB2	P05538	268 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SBK3	P0C264	359 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	AP2B1	P63010	937 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TSPY1	Q01534	308 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	KLC1	Q07866	573 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PIGN	O95427	931 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SKI	P12755	728 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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