RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627490.2

PBX1-222, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PBX1, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-222ENST00000627490 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.5■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.5■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 A0A0U1RQF3 1178 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 MGEA5O60502 916 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 GLDCP23378 1020 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ARRB2P32121 409 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TKTL1P51854 596 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 COG7P83436 770 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TLE2Q04725 743 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ASPHQ12797 758 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TRIM60Q495X7 471 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 GBP5Q96PP8 586 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SERPINI1Q99574 410 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 VPS28Q9UK41 221 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CSRP3P50461 194 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CLCN2P51788 898 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 MTTPP55157 894 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 DAOAP59103 153 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 NME3Q13232 169 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ANO4Q32M45 955 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 KCNMB4Q86W47 210 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 MED10Q9BTT4 135 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 RGS18Q9NS28 235 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 OXSMQ9NWU1 459 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TBX21Q9UL17 535 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 BRCA2P51587 3418 aa20.49■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 C2P06681 752 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CUL3Q13618 768 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 HERC3Q15034 1050 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ARMC3Q5W041 872 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CES3Q6UWW8 571 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 C16orf89Q6UX73 402 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 MFN1Q8IWA4 741 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TSGA13Q96PP4 275 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 GPR22Q99680 433 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 EPAS1Q99814 870 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ADAM2Q99965 735 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CEP41Q9BYV8 373 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 DRC3Q9H069 523 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 HIPK3Q9H422 1215 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 POMPQ9Y244 141 aa20.48■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 KCNK1O00180 336 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CDH17Q12864 832 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 GPNMBQ14956 572 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 UGP2Q16851 508 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 BTBD9Q96Q07 612 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SH3GL3Q99963 347 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 RNF39Q9H2S5 420 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 TLK1Q9UKI8 766 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 MATN2O00339 956 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 HDAC3O15379 428 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 NBNO60934 754 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 CXCL10P02778 98 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 FYNP06241 537 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PEX19P40855 299 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 LHX1P48742 406 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 PRKAA1Q13131 559 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 RAB41Q5JT25 222 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 LIPMQ5VYY2 423 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-222ENST00000627490 VPS39Q96JC1 886 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms