RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 FAM92AA1XBS5 289 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 F8W810 466 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCRL2O00421 344 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KCNQ2O43526 872 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CSPG5O95196 566 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SCN1BQ07699 218 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RDH11Q8TC12 318 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 WDCPQ9H6R7 721 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MKLN1Q9UL63 735 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 VPS4AQ9UN37 437 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LGR5O75473 907 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PRKD3O94806 890 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CHRNA5P30532 468 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ECT2LQ008S8 904 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZBED5Q49AG3 693 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PMF1Q6P1K2 205 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LZTR1Q8N653 840 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 Q96MT0 163 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.96□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 PLK4O00444 970 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 ERBB2P04626 1255 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 HNF4AP41235 474 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 SLC9A3P48764 834 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 NR2C2P49116 596 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TROAPQ12815 778 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 CNTN1Q12860 1018 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 UROC1Q96N76 676 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 PXMP2Q9NR77 195 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 COMMD9Q9P000 198 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 RNF112Q9ULX5 631 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TNS2Q63HR2 1409 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 A0A0U1RQJ8 604 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 ILVBLA1L0T0 632 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 VPS26AO75436 327 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 SNAPC5O75971 98 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TCF4P15884 667 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 GABRB2P47870 512 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 IL18R1Q13478 541 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 METTL7BQ6UX53 244 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TMC7Q7Z402 723 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 CHSY1Q86X52 802 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 NXNL1Q96CM4 212 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 RNF38Q9H0F5 515 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 CHADO15335 359 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 CDC42P60953 191 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-211ENST00000613795 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms