RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612199.4

SRGAP2B-204, Transcript of SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRGAP2B, Length 7,120 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2B-204ENST00000612199 DDI1Q8WTU0 396 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 DPF1Q92782 380 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 AP1S3Q96PC3 154 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 E5RJQ4 531 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ULK1O75385 1050 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RECQL4O94761 1208 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 AMPD1P23109 780 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CTNNB1P35222 781 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACOX1Q15067 660 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR10G6Q8NH81 332 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TINF2Q9BSI4 451 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACOT9Q9Y305 439 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 SCTRP47872 440 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 LHX1P48742 406 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 MGAT5Q09328 741 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 POU6F1Q14863 301 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 UGCGQ16739 394 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 WDR59Q6PJI9 974 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CES3Q6UWW8 571 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 PORCNQ9H237 461 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ASTN1O14525 1302 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CBX4O00257 560 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RIPK2O43353 540 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TNFSF9P41273 254 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 WNK4Q96J92 1243 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RRN3Q9NYV6 651 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMCO1Q9UM00 188 aa9.6□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 PAEPP09466 180 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 NR2F1P10589 423 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CCNOP22674 350 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 SSTR1P30872 391 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 POU4F1Q01851 419 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CHPFQ8IZ52 775 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 PIGUQ9H490 435 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR10H2O60403 315 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 PGK1P00558 417 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RANBP1P43487 201 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 MPP2Q14168 576 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 DAW1Q8N136 415 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CREBZFQ9NS37 354 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM25AB3EWG3 89 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM25CB3EWG5 89 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM25GB3EWG6 89 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 SH3BGRLO75368 114 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 MT-CO1P00395 513 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RBP1P09455 135 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FUT2Q10981 343 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 NAXEQ8NCW5 288 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 COQ8AQ8NI60 647 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FICDQ9BVA6 458 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 VTA1Q9NP79 307 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CHST7Q9NS84 486 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ABI3Q9P2A4 366 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RCCD1A6NED2 376 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ALDH2P05091 517 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 CALB2P22676 271 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 GRK4P32298 578 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 S100A5P33763 92 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 NME5P56597 212 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FOXM1Q08050 763 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FUT11Q495W5 492 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.59□□□□□ -0.87
SRGAP2B-204ENST00000612199 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms