RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591417.5

HKR1-222, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 4 BASIC

Gene HKR1, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-222	ENST00000591417	SGCG	Q13326	291 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TTC9	Q92623	222 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417		K7ENP7	123 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	FPGT	O14772	594 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TPP1	O14773	563 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	AQP9	O43315	295 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SLC28A2	O43868	658 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TCEA3	O75764	348 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	NEBL	O76041	1014 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	GNA14	O95837	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	MT-CO1	P00395	513 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CTSL	P07711	333 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	MYF5	P13349	255 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TGM2	P21980	687 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	NEK3	P51956	506 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PDCL	Q13371	301 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	NR0B2	Q15466	257 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	CDKN3	Q16667	212 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PARG	Q86W56	976 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	BMF	Q96LC9	184 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	WDCP	Q9H6R7	721 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HKR1-222	ENST00000591417	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	PAGE1	O75459	146 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	WISP1	O95388	367 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	JUND	P17535	347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	RRM1	P23921	792 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	NOS2	P35228	1153 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FZD2	Q14332	565 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TAF5	Q15542	800 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	LMX1A	Q8TE12	382 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	NAT6	Q93015	286 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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