RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT83P78385 493 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 TMIEQ8NEW7 156 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 SPASTQ9UBP0 616 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 CFAP45Q9UL16 551 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 RP1P56715 2156 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 FPGTO14772 594 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC2A3P11169 496 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 SRCP12931 536 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 SGCGQ13326 291 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ARSIQ5FYB1 569 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXL22Q6P050 247 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 UBR7Q8N806 425 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ALG14Q96F25 216 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 FEM1CQ96JP0 617 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 STRADBQ9C0K7 418 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 KLF15Q9UIH9 416 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 TPP1O14773 563 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 PPFIA2O75334 1257 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 MT-CO1P00395 513 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ANXA6P08133 673 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ACADSBP45954 432 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 TLE1Q04724 770 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf61Q13536 156 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 MANEAQ5SRI9 462 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB11FIP2Q7L804 512 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 CHST14Q8NCH0 376 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 NT5C1BQ96P26 610 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 GULP1Q9UBP9 304 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 IL36AQ9UHA7 158 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-205ENST00000588780 COL12A1Q99715 3063 aa22.27■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 K7ERQ8 282 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 AGRPO00253 132 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 RAD51BO15315 384 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 ENDOD1O94919 500 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 JMJD7P0C870 316 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 ITGB6P18564 788 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 RRM1P23921 792 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 CCR1P32246 355 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 UGT1A5P35504 534 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 NEK3P51956 506 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 RBFAQ8N0V3 343 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 HDAC8Q9BY41 377 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 DDIT4Q9NX09 232 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 PADI4Q9UM07 663 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 SNAP91O60641 907 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 HGFP14210 728 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 GGCXP38435 758 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 SYKP43405 635 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 THOP1P52888 689 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 PDX1P52945 283 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK17Q00537 523 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 BEND5Q7L4P6 421 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 MED15Q96RN5 788 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 BOCQ9BWV1 1114 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 PISDQ9UG56 409 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 NEMP1O14524 444 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-205ENST00000588780 CLDN11O75508 207 aa22.24■■□□□ 1.15
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