RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	HSD3B1	P14060	373 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PSMA3	P25788	255 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	NAMPT	P43490	491 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	GATM	P50440	423 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PTEN	P60484	403 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	UBE3A	Q05086	875 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CUL4A	Q13619	759 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CAPS	Q13938	189 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	STAT4	Q14765	748 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	MAPK6	Q16659	721 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	GPR158	Q5T848	1215 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	SNX32	Q86XE0	403 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	POF1B	Q8WVV4	589 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF558	Q96NG5	402 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	SZT2	Q5T011	3432 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A087WWV3	80 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	EPOP	A6NHQ4	379 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PP2D1	A8MPX8	630 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	SMTNL1	A8MU46	457 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792		E9PMD0	336 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792		H0YCG3	227 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	DVL2	O14641	736 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	GABRD	O14764	452 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	NCK2	O43639	380 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	TSPAN1	O60635	241 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	FGF18	O76093	207 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	APOL3	O95236	402 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CFI	P05156	583 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PRKCB	P05771	671 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CYP11B2	P19099	503 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	SYT1	P21579	422 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	GLRA2	P23416	452 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ABCD1	P33897	745 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ARL2	P36404	184 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	RXRG	P48443	463 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	NDUFV1	P49821	464 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	EFNA5	P52803	228 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	APBA1	Q02410	837 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CD69	Q07108	199 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	GTF2H3	Q13889	308 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	BECN1	Q14457	450 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	STK38	Q15208	465 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	DHCR24	Q15392	516 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CNTD1	Q8N815	330 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	SNX21	Q969T3	373 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CPB2	Q96IY4	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	APOL6	Q9BWW8	343 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	KLK15	Q9H2R5	256 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	KCND2	Q9NZV8	630 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	STK39	Q9UEW8	545 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CDH23	Q9H251	3354 aa		5	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		5	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792		K7ERI5	159 aa		5	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	GRM6	O15303	877 aa		5	□□□□□ -1.61
ZNF540-204	ENST00000586792	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		5	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms