RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IPMKQ8NFU5 416 aa16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC39A13Q96H72 371 aa16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NMRAL1Q9HBL8 299 aa16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 E2F8A0AVK6 867 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOA4P06727 396 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC2A3P11169 496 aa16.75■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C14orf80Q86SX3 495 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RDH11Q8TC12 318 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC01599Q8WXQ3 324 aa16.75■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.75■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GABRB3P28472 473 aa16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RCN2Q14257 317 aa16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MBTPS1Q14703 1052 aa16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POU6F1Q14863 301 aa16.74■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYN3O14994 580 aa16.73■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAGEA11P43364 429 aa16.73■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.73■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBXO27Q8NI29 283 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TREX1Q9NSU2 369 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OXSMQ9NWU1 459 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TLK1Q9UKI8 766 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM92AA1XBS5 289 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TM7SF2O76062 418 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEX11BO96011 259 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RHOQP17081 205 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARNTP27540 789 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELF1P32519 619 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GCKP35557 465 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRKAA2P54646 552 aa16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBX4P57082 545 aa16.73■□□□□ 0.27
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