RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	APC2	O95996	2303 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514		A0A1W2PR77	199 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRC53	A6NM62	1247 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	EPHB6	O15197	1021 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	BNIP3L	O60238	219 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CYP11B1	P15538	503 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CXCR3	P49682	368 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SULT1E1	P49888	294 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CDH4	P55283	916 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CNTN1	Q12860	1018 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TUBB2A	Q13885	445 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SPA17	Q15506	151 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	INAVA	Q3KP66	663 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C5orf22	Q49AR2	442 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ALF	Q53S48	1182 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TAF3	Q5VWG9	929 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514		Q6ZVU0	165 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	MDM1	Q8TC05	714 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C18orf8	Q96DM3	657 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	GDF3	Q9NR23	364 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	RRN3	Q9NYV6	651 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514		I6L893	689 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TLR4	O00206	839 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	MCF2L	O15068	1137 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	LAT	O43561	262 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	MT-CO1	P00395	513 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FER	P16591	822 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	STAT1	P42224	750 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	JAM2	P57087	298 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DEUP1	Q05D60	604 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SHB	Q15464	509 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C2CD6	Q53TS8	623 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SAP25	Q8TEE9	199 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	NT5C3B	Q969T7	300 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TBCB	Q99426	244 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ACACA	Q13085	2346 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM149A	A5PLN7	773 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ALOX15B	O15296	676 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC7A4	O43246	635 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	KRT86	O43790	486 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	KIF5C	O60282	957 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SNAP91	O60641	907 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ITGAV	P06756	1048 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	RHOC	P08134	193 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SRC	P12931	536 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	GABRB2	P47870	512 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	NXPH1	P58417	271 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ASIC2	Q16515	512 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	AGBL4	Q5VU57	503 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	VPS36	Q86VN1	386 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ERICH1	Q86X53	443 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	XYLT1	Q86Y38	959 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PSMB7	Q99436	277 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DEF6	Q9H4E7	631 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	MPP6	Q9NZW5	540 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	LHX6	Q9UPM6	363 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PLXNA2	O75051	1894 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TMEM131	Q92545	1883 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514		A0A0D9SEW6	157 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DRGX	A6NNA5	263 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514		K7ERQ8	282 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CBX4	O00257	560 aa		15.91	■□□□□ 0.14

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