RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	SGCG	Q13326	291 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CDO1	Q16878	200 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CARD16	Q5EG05	197 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	STRADA	Q7RTN6	431 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DRC7	Q8IY82	874 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	OR7D4	Q8NG98	312 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	MDM1	Q8TC05	714 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NXPE2	Q96DL1	559 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ANO10	Q9NW15	660 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743		K7ERQ8	282 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	LEFTY1	O75610	366 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ENDOD1	O94919	500 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	KRT3	P12035	628 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	MMP8	P22894	467 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ITGB7	P26010	798 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ADRA1B	P35368	520 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PTPN9	P43378	593 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DAB2	P98082	770 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	E2F1	Q01094	437 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RAD51	Q06609	339 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	BNIP3	Q12983	259 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	KRT31	Q15323	416 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PLPP6	Q8IY26	295 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CALN1	Q9BXU9	219 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743		A6NNZ2	444 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743		H3BM21	787 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TAF4	O00268	1085 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RAMP2	O60895	175 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CAPNS1	P04632	268 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CTSL	P07711	333 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PRLR	P16471	622 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RHOQ	P17081	205 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	L1CAM	P32004	1257 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ACADVL	P49748	655 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TAS2R38	P59533	333 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SHB	Q15464	509 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	EMC1	Q8N766	993 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	KLK6	Q92876	244 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	MYOC	Q99972	504 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PTPRB	P23467	1997 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	FAM170A	A1A519	330 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743		I6L893	689 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms