RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FLNC	Q14315	2725 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TNFSF14	O43557	240 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPAN3	O60637	253 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CLSTN1	O94985	981 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FSBP	O95073	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SEMA4F	O95754	770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HLA-F	P30511	346 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CCT8	P50990	548 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CLCN7	P51798	805 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NDST1	P52848	882 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BIRC3	Q13489	604 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NCAPH	Q15003	741 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SURF1	Q15526	300 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CDC6	Q99741	560 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TULP2	O00295	520 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BRINP1	O60477	761 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RFPL3	O75679	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BMP15	O95972	392 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ACADM	P11310	421 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CD27	P26842	260 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	OXTR	P30559	389 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ATIC	P31939	592 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CD70	P32970	193 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NUMB	P49757	651 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF11	P52732	1056 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	METAP1	P53582	386 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP2CB	P62714	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP2CA	P67775	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CXADR	P78310	365 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ASIC1	P78348	528 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CFHR1	Q03591	330 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TLE3	Q04726	772 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BNIP3	Q12983	259 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPC3	Q13507	836 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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