RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZACNQ401N2 412 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AMACRQ9UHK6 382 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CDH7Q9ULB5 785 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AK5Q9Y6K8 562 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PPC1 479 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 OR10H2O60403 315 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC9A1P19634 815 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MORN1Q5T089 497 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ACOT9Q9Y305 439 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CTSAP10619 480 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KRT4P19013 534 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IFNGR2P38484 337 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LMAN2Q12907 356 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GRM2Q14416 872 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF670Q9BS34 389 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FZD8Q9H461 694 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ASB8Q9H765 288 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KCNJ13O60928 360 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PON1P27169 355 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PCK1P35558 622 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RAP1GAPP47736 663 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CRY1Q16526 586 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF576Q9H609 170 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 USP54Q70EL1 1684 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FAM205CA6NFA0 338 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KRT33AO76009 404 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ALPPP05187 535 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IL10P22301 178 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NDST2P52849 883 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NTRK3Q16288 839 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DDR2Q16832 855 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 JADE3Q92613 823 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF333Q96JL9 665 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KLQ9UEF7 1012 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CFL2Q9Y281 166 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ALG6Q9Y672 507 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 COMTP21964 271 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PMS2P54278 862 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC12A3P55017 1021 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KCNMA1Q12791 1236 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ING5Q8WYH8 240 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IL22Q9GZX6 179 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MAN1A2O60476 641 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 C1RP00736 705 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC130P13994 396 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IL2P60568 153 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ESRRGP62508 458 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RBPJQ06330 500 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CDC16Q13042 620 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LONRF1Q17RB8 773 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PACS1Q6VY07 963 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DLG3Q92796 817 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 EML1O00423 815 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 E2F3O00716 465 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms